2.工艺不同

酸奶是在制作过程中将乳酸菌菌种添加到牛奶或奶粉中，并在符合条件的温度下制成。如果是加入鲜牛奶，那该商品名称一般可称之为酸牛奶；加入到奶粉中，则该商品名称就有多种叫法了。而益生菌则是经过恒定的温度湿度水解、发酵工艺和冷却萃取等一系列工艺流程才能完成。

3.菌发挥功效的方式不同

酸奶中的菌种是在进入消化道，尤其是到达结肠才起作用。而在经过消化道途中，特别是路过胃脏时，因胃酸浓度关系，不利于乳酸菌存活并顺达“目的地”，菌株数会被急剧减少。

益生菌制品菌种是通过冷冻干燥之后，处于休眠状态，口服之后到达肠道才被唤醒，紧接着“恢复神态”发挥作用。

4.归类属性不同

众所周知，酸奶属于食品，适用人群非常广泛，不过敏即可。而益生菌则不同，有食品级，也有药品级，服用时要特别注意区分：服用食品级的益生菌，要仔细阅读产品说明书；作为药品的益生菌，要遵从医嘱，对于服用时长、服用剂量等方面都要在专业医生的指导下正确施行，才能起到调节肠道菌群的作用，获得满意的治愈效果。

特别要提醒的一点是，有些人（如胃酸过多、消化道溃疡、胃肠道手术恢复期、原发性或继发性免疫缺陷症患者等等）不适合吃益生菌，还有2岁以下的婴幼儿也不适合吃。总之，要因人而异，因人制宜。

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